گونه های شاخص جانوری پناهگاه حیات وحش خارک را آهو و انواع پرندگان دریایی آبزی و کنار آبزی تشکیل می دهند. در جریان سرشماری تابستان ۱۳۹۲ در مجموع ۴۱۱ رأس آهو در جزیره خارک شمارش شد که تعداد ۲۰۳ رأس نر و بقیه ماده و یا نامشخص (نابالغ و یا عدم تشخیص وجود شاخ) بوده اند. کارکنان شرکت پایانه های نفتی در کنار فعالیتهایشان، حفاظت و تامین آب و خوراک این حیوانات را به عنوان یک دوستدار محیط زیست به عهده دارند.